简介

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古淡水生物学分类与生态学学科组

简介

古淡水生物学是研究淡水生命现象和生物活动规律的科学。生物学是研究生物各个层次的种类、结构、发育和起源进化以及生物与周围环境的关系的学科。人是生物的一种，也是生物学研究的对象。

生物学是自然科学的一个门类。研究生物的结构、功能、发生和发展的规律。根据研究对象，分为动物学、植物学、微生物学等；根据研究内容，分为分类学、解剖学、生理学、遗传学、生态学等。是研究生物各个层次的种类、结构、功能、行为、发育和起源进化以及生物与周围环境的关系等的科学。

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在自然科学还没有发展的古代，人们对生物的五光十色、绚丽多彩迷惑不解，他们往往把生命和无生命看成是截然不同、没有联系的两个领域，认为生命不服从于无生命物质的运动规律。不少人还将各种生命现象归结为一种非物质的力，即“活力”的作用。这些无根据的臆测，随着生物学的发展而逐渐被抛弃，在现代生物学中已经没有立足之地了。

20世纪特别是40年代以来，生物学吸收了数学、物理学和化学等的成就，逐渐发展成一门精确的、定量的、深入到分子层次的科学。人们已经认识到生命是物质的一种运动形态。生命的基本单位是细胞，它是由蛋白质、核酸、脂质等生物大分子组成的物质系统。生命现象就是这一复杂系统中物质、能和信息三个量综合运动与传递的表现。生命有许多为无生命物质所不具备的特性。例如，生命能够在常温、常压下合成多种有机化合物，包括复杂的生物大分子；能够以远远超出机器的生产效率来利用环境中的物质和能制造体内的各种物质，而不排放污染环境的有害物质；能以极高的效率储存信息和传递信息；具有自我调节功能和自我复制能力；以不可逆的方式进行着个体发育和物种的演化等等。揭露生命过程中的机制具有巨大的理论和实践意义。

古淡水生物学分类与生态学学科组

学科带头人：余育和

学科组成员：余育和、冯伟松、龚迎春、颜庆云，博士生2人，硕士生3人。

学科组介绍：本学科组源于著名原生动物学家王家楫院士三十年代所创建的浮游动物组。七十余年来，在以王家楫院士和沈韫芬院士为代表的数代学人的不懈努力下，本学科组已积淀雄厚的硬件和软件基础，具备从不同学科领域、不同层次结构对原生动物进行研究的实力。现有高级显微镜室、普通生态学实验室与分子生物学实验室。目前主要研究方向为：（1）结合形态学、分子生物学、生物信息学等多种研究手段，对原生动物主要类群的物种多样性及其系统演化进行研究，尝试建立一个能反映其自然关系的分类系统；（2）结合DNA指纹分析、物种鉴定及理化分析，探索并建立浮游动物群落级生命系统DNA指纹分析技术，进而揭示不同水体生态系统浮游动物遗传结构并探讨生态问题的分子机制，建立指纹图谱与物种组成及理化因子间关系的模型、建立水资源质量的分子生物评价体系；此外，本学科组还负责主持中国动物学会原生动物学分会工作。

仪器设备：Zeiss Axioplan 2 Imaging显微成像系统；Ingeny phorU突变分析系统；Bio-Rad Dcode系统； UVP凝胶成像系统；Bio-Rad梯度PCR仪；Rowen -86℃ZKU-L300 超低温冰箱；BECKMAN AllegraTM 64R Centrifuge；BECKMAN DU530 DNA/Protein Analyzer；AB204电子天平；SZX单人超净工作台； Carl Zeiss JENA 显微镜；Leitz 显微镜；Olympus显微镜；Leitz倒置显微镜；Wild解剖镜；101-1型电热恒温干燥箱；普通冰箱；低温冰箱；THZ-C恒温水浴锅；ML-902定时恒温磁力搅拌器；TS-8转移脱色摇床；Ql-901旋涡混合器；Galanz微波炉。

承担课题：

课题名称　项目类别　经费(万元)　起止时间

草鱼消化道内微生物及其与饵料组成的关系　国家自然科学基金　33　2010-2012

缘毛类纤毛虫DNA条形码分析及其系统发育研究　国家自然科学基金　21　2010-2012

钉螺消化道微生物及其与钉螺感染性的关系　中科院重要方向性项目　20　2009-2010

草鱼消化道微生物群落结构及其与食性的关系　973子课题　105　2009-2013

DNA Barcoding在缘毛类纤毛虫分类学中的应用　国家重点实验室开放课题　6　2009-2009

浮游动物群落及其DNA指纹结构对改性土壤除藻处理的效应　973子课题　52　2008-2013

DNA Barcoding在钟虫物种鉴定中的应用　中国科学院基金　10　2008-2011

浮游生物群落宏基因组与其环境理化因子的关系　国家自然科学基金　40　2008-2010

转基因鱼试验湖浮游动物群落结构及其DNA指纹分析　973子课题　20　2007-2011

滇池福保湾浮游动物群落研究　863子课题　5　2007-2007

浮游生物群落DNA指纹拓扑结构与物种多样性　国家自然科学基金　28　2006-2008

松花江重大污染事故特征污染物的人体健康风险评估　国家应急项目　10　2005-2006

中山市浮游动物资源调查　横向　7　2005-2006

浮游动物群落结构及其遗传结构对生源要素变化的响应　国家自然科学基金　20　2004-2008

富营养化对原生动物遗传结构的影响　973子课题　25　2003-2007

长江流域有壳肉足虫分类区系研究　国家自然科学基金　16　2003-2005

车轮虫分子系统发育　国家自然科学基金　24　2003-2005

缘毛类纤毛虫微卫星DNA多态性研究　知识创新工程方向性项目　60　2002-2004

微型生物信息管理及研究　国家自然科学基金对外交流合作项目　6　2002-2004

车轮虫（Trichodinid）系统发育研究　院区系项目　5　2002-2004

缘毛类纤毛虫系统学研究　重点实验室开放课题　5　2001-2003

发表论文：

1. Yan QY, Yu YH, Feng WS, Pan G, Chen H, Chen J, Yang B, Li XM, Zhang X. 2009. Plankton community succession in artificial systems subjected to cyanobacterial blooms removal using chitosan-modified soils. Microbial Ecology, 58(1): 47-55.

2. Wu L, Yu YH, Feng WS, et al. 2009. Genetic diversity of the plankton community and its relation to taxonomic composition and environmental factors in lake Xiliang. Journal of Freshwater Ecology, 24(1): 125-134.

3. Wu L, Yu YH, Zhang TL, Feng WS, Zhang X, Li W. 2009. PCR-DGGE fingerprinting analysis of plankton communities and its relationship to lake trophic status. International Review of Hydrobiology,(in press)

4. Yu YH, Yan QY, Feng WS. 2008. Spatiotemporal heterogeneity of plankton communities in Lake Donghu, China, as revealed by PCR-denaturing gradient gel electrophoresis and its relation to biotic and abiotic factors. FEMS Microbiology Ecology, 63(3): 328-337.

5. Yan QY, Yu YH, Feng WS, Yu ZG, Chen HT. 2008. Plankton community composition in the Three Gorges Reservoir Region revealed by PCR-DGGE and its relationships with environmental factors. Journal of Environmental Sciences, 20(6): 732-738.

6. Chen XJ, Feng WS, Miao W, Yu YH, et al. 2008. A microcalorimetric assay of tetrahymena thermophila for assessing tributyltin acute toxicity. Journal of Thermal Analysis and Calorimetry, 94(3): 779-784.

7. Chen XJ, Feng WS, Yu YH, et al. 2008. Studies on the toxic effects of La3+ to Tetrahymena thermophilaby microcalorimetry. Biological Trace Element Research, 123(1-3): 242-249.

8. Wu L, Feng WS, Yu YH, Shen YF. 2007. Temporal and spatial variations in the species composition, distribution, and abundance of protozoa in East Dongting lake, China. Journal of Freshwater Ecology, 22(4): 655-665.

9. Yan QY, Yu YH, Feng WS, Deng WN, Song XH. 2007. Genetic diversity of plankton community as depicted by PCR-DGGE fingerprinting and its relation to morphological composition and environmental factors in Lake Donghu.Microbial Ecology, 54(2): 290-297.

10. Gong YC, Yu YH, Zhu FY, Feng WS. 2007. Molecular phylogeny of Stentor (Ciliophora: Heterotrichea) based on small subunit ribosomal RNA sequences. Journal of Eukaryotic Microbiology, 54(1): 45-48.

11. Chen XJ, Feng WS, Miao W, Shen YF, Yu YH. 2007. Effects of ytterbium ion on the growth, metabolism and membrane fluidity of Tetrahymena thermophila. Journal of Thermal Analysis and Calorimetry, 89(3): 835-839.

12. Yan QY, Yu YH, Feng WS, Zhang WJ. 2006. DNA polymorphism of the plankton community and its relationships to species composition in the Three Gorges Reservoir Region of the Yangtze River. Journal of Freshwater Ecology,21: 385-391.

13. Yan QY, Yu YH, Feng WS. 2006. Genetic fingerprinting of plankton community provides new insights in aquatic ecology. Progress in Natural Science, 16(9): 893-898.

14. Gong YC, Yu YH, Villalobo E, Zhu FY, Miao W. 2006. Reevaluation of the phylogenetic relationship between Mobiline and Sessiline Peritrichs (Ciliophora, Oligohymenophorea) based on sequences of 18S small subunit rRNA genes. Journal of Eukaryotic Microbiology, 53(5): 397-403.

15. Zhang WJ, Yang J, Yu YH, Shu SW, Shen YF. 2006. Population genetic structure of Carchesium polypinum (Ciliophora: Peritrichia) in four Chinese lakes inferred from ISSR fingerprinting: high diversity but low differentiation. Journal of Eukaryotic Microbiology, 53(5): 358-363.

16. Wang AQ, Yu YH, Zhang WJ, Gong YC. 2006. Heterogeneity studies of Carchesium polypinum (Ciliophora: Peritrichida) in Donghu Lake. Acta Ecologica Sinica, 26(3): 895-900.

17. Chen XJ, Miao W, Liu Y, Shen YF, Feng WS, Yu T, Yu YH. 2006. Microcalorimetry as a possible tool for phylogenetic studies of Tetrahymena. Journal of Thermal Analysis and Calorimetry, 84(2): 429-433.

18. Chen XJ, Feng WS, Shen YF, Liu Y, Miao W, Yu YH. 2005. Application of polyurethane foam units and calorimetry to microbial monitoring in Lake Donghu. Thermochimica Acta, 438 (1-2): 63-69.

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21. Yu YH, Feng WS, Shen YF, Ye ZH, Wang MH. 2005. Use of microbial community to evaluate performance of a wetland system in treating Pb/Zn mine drainage. Environmental Management, 36(6): 842-848.

22. Zhang WJ, Yu YH, Shen Y F. 2005. Genetic relationships and phylogenetic characters of five peritrichous ciliates inferred from inter simple sequence repeat (ISSR) molecular markers. Acta Zootaxonomica Sinica, 30(4): 659-665.

23. Shi XL, Warren A, Yu YH, Shen YF. 2004. Infraciliature and myoneme system of Campanella umbellaria (Protozoa, Ciliophora, Peritrichida). Journal of Morphology, 261: 43-51.

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26. Gu XW, Yu YH, Shen YF. 2004. Phylogenetic studies on the bodonid flagellates using small-subunit rRNA sequences.Acta Zootaxonomica Sinica, 29(3): 396-405.

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38. 吴利, 余育和, 张堂林, 冯伟松, 颜庆云, 龚迎春, 宋晓红. 2008. 牛山湖浮游生物群落DNA指纹结构与理化因子的关系. 湖泊科学, 20: 235-241.

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