共聚焦激光显微内镜来自于实验室常用的共聚焦显微镜，是将传统实验室桌面使用的共聚焦显微内镜原理运用到内窥镜技术当中。具体方法是在内窥镜头端整合一个共聚焦激光探头，通过特殊的荧光剂，使用激光激发产生人体局部组织学图像的装置。目前该装置为原Pentax公司独家生产，国内已经开始将其运用到胃镜和结肠镜的检查当中。目前的临床实践表明该装置对于某些胃肠道常见疾病，比如食管炎、Barrett食管、食管‘癌、胃炎、胃肠上皮化生、胃不典型增生、溃疡性结肠炎、结肠息肉、结肠癌，尤其是较小病灶以及早期胃肠道肿瘤的诊断具有快速、准确的优势，并有可能在未来替代传统的内镜活检与病理学检查。

目前开展该检查项目的单位包括山东大学齐鲁医院和北京301医院等多家医院，其中山东大学齐鲁医院是国内最早开展共聚焦激光显微内镜的医疗单位，在胃肠道疾病的共聚焦显微内镜诊断方面积累了丰富的经验，已经在国际学术期刊上发表相关学术论文多篇。

共聚焦激光显微内镜的准备和操作与一般内窥镜检查大致相同，唯需要在检查过程中使用特殊的荧光剂，如静脉注射荧光素钠，和局部喷洒吖啶黄溶液。当前的临床实践证明，荧光素钠仅在一少部分人中发生皮疹、瘙痒类的不良反应，大多较轻，经抗过敏治疗后均可好转。无其他不良反应报道。