阜南县公安局内设政治工作室、办公室、法制股、出入境管理股、后勤装备股、户政股、警卫股、信访室、调研室、国内安全保卫大队、经济文化保卫股、治安股等十二个单位,直属指挥中心、刑事警察大队、巡逻警察大队、警务督察大队、经济犯罪侦查大队、交通警察大队、曹集公安分局等七个单位,下设看守所、拘留所两个单位及派出单位36个,担负着维护全县社会政治稳定、打击和预防违法犯罪、保护人民生命财产安全、管理社会治安的重要职能。