福建省腹部外科研究所成立于1995年，并于1996年成为福建省科技厅优先发展科所，挂靠福建医科大学附属第一医院，现设4个研究室，2个实验室。实验室面积120M2，仪器设备价值280万元人民币。临床基地因拥有普外科、肿瘤外科和小儿外科等6个病区，240余张病床。研究所的工作人员有60多人。其中教授、主任医师13人，副教授、副主任医师11人，主治医生18人；拥有博士12人，硕士25人；博士生导师1人，硕士生导师13人。福建省腹部外科研究所以临床应用研究为主，同时加强基础研究，强调临床与基础相结合，对腹部外科的多个领域进行了深入研究，形成了肝胆胰外科、胃肠外科、腔镜微创外科、血管外科和乳腺外科等在省内处于领先水平的特色学科。