冯士翙，北燕冯熙后裔。北燕亡后，族人逃亡新罗，父冯业回广东新会定居。

冯士翙历任隋朝的冈州刺史，唐朝的罗州、窦州刺史、上柱国合浦郡开国公、右武卫将军。

唐武德六年七月，时任隋朝的冈州刺史的冯士翙据广东新会起兵反唐，广州刺史刘感出兵讨伐，以官复原职为条件劝降，冯士翙投降了唐朝，后任罗州剌史。

永徽五年，冯士翙任窦州剌史，封上柱国合浦郡开国公、右武卫将军。成为当地的俚僚众酋首领，冯士翙在窦州(今广东信宜市镇隆镇)建万年宫，刻立万年宫碑铭，歌颂唐朝恩德！

显庆五年，冯士翙与庞孝泰率领岭南兵随唐大军征高丽。

龙朔三年，五月，壬午，柳州蛮酋长吴君解反叛；朝庭遣冀州长史刘伯英、右武卫将军冯士翙发岭南兵讨伐。