生态系统的分解是死有机物质的逐步降解过程，它由多种生物共同完成。分解过程比较复杂，大致分为三个阶段：

1、是机械作用阶段：由于物理的和生物的作用，动植物遗体被分解成为颗粒和碎屑，即碎裂。

2、是生物异化作用阶段：腐生生物在酶的作用下，把有机物碎屑转变成为腐殖酸和其他可溶性有机物，即从聚合体变成单体．然后腐殖酸和其它可溶性有机物缓慢分解，逐步变成生产者可以重新利用的无机物。

3、淋溶过程：可溶性物质被水淋洗出来，进入土壤。在自然界中，这三个过程是交叉进行、相互影响的。

例如：在叶的分解过程中，当叶还在植物体上时，微生物已经开始分解作用，枯枝败叶一旦落到地面，就为细菌、真菌和线菌和放线菌等微生物分解，同时也被一些无脊椎动物如蜈蚣．弹尾．蚯蚓等摄食，大量的未被消化的有机物残体通过消化道排出，使叶等有机物暴露面积增加十多倍，更容易被微生物分解。从该意义上讲，大部分分解者既是消费者又是分解者。

有机残体进入土壤，被分解者开始分解后，物理的和生物的分解复杂性一般随时间的推移而增加，分解者生物的多样性也增加，随分解过程的进展，分解速度逐渐降低，待分解的有机物的多样性也降低，直到最后都还原成为无机物。

各类有机物被分解的速度也不同，一般葡萄糖分解较快，3天中有50％的被分解；纤维素分解较慢，24天中只有65％的被分解；腐殖质分解最慢，在灰壤中能保存250年左右。