非编码RNA（Non-Coding RNA），指的是不被翻译成蛋白质的RNA，如tRNA, rRNA等，这些RNA不被翻译成蛋白质，但是其中有一些会参与蛋白质翻译过程。

此外还有snRNA,snoRNA等参与RNA剪接和RNA修饰，

miRNA也是非编码RNA，是小的RNA分子，与转录基因互补，介导基因沉默（RNAi）。

gRNA又称引导RNA，真核生物中参与RNA编辑的具有与mRNA互补序列的RNA；

eRNA，从内含子（introns）或DNA非编码区转录的RNA分子，精细调控基因的转录和翻译效率；

SNP RNA，信号识别颗粒RNA，细胞质中与含信号肽mRNA识别，决定分泌的RNA功能分子；

pRNA，噬菌体RNA，fi29噬菌体中用6个同样的小RNA分子利用ATP参与DNA的包装；

tmRNA，具有tRNA样和mRNA样复合的RNA，广泛存在细菌中，识别翻译或读码有误的核糖体，也识别那些延迟停转的核糖体，介导这些有问题的核糖体的崩解；

最后就是mRNA中的非翻译区，含有核糖体识别元件如5'-UTR,3'-UTR等。

长链非编码RNA（large intergenic non-coding RNA，lincRNA） 虽然与蛋白质合成无关，但能形成一定的二级结构，并调节蛋白质的活性。lincRNA有很多功能，目前被认为能与蛋白质形成复合体，调节蛋白的功能。