简介

主要研究领域：

代表论著：

简介

方向东，博士，研究员，博士研究生导师。1986-1992年，第一军医大学(现南方医科大学)六年制临床医学本科生。1992-1995年，第一军医大学免疫学硕士研究生。1993-1995年，中国科学院上海生物化学研究所国家分子生物学重点实验室访问学者。1995-1996年，第一军医大学分子免疫学研究所助教。1996-1999年，第一军医大学人体解剖学和组织胚胎学博士研究生。1997-2000年，中科院上海生物化学研究所访问学者。2000-2003年，美国华盛顿大学医学院博士后。2003-2007年，美国华盛顿大学医学院讲师。2007-2009年，美国华盛顿大学医学院助理教授。2009年应聘为中国科学院北京基因组研究所 “百人计划”研究员。

近年来以人类珠蛋白的转基因小鼠为模型，利用Real-Time PCR和新一代高通量测序为基础的DNase I作图、染色质免疫沉淀(ChIP)、染色体构象捕获(3C)等表观遗传学技术，研究真核细胞中非基因编码区的顺式调控元件的作用机制。发现：1) Pol II、TBP、TFIIB等重要转录因子与真核基因启动子区域内的顺式调控元件的结合与真核基因的转录调控密切相关；同时，具有不同发育时期的特异性(Duan et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2002；Fang et al. J. Biol. Chem., 2004；Li et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2004；Li et al. Nucleic. Acids Res., 2006)。2) 位于珠蛋白基因上游15-25 kb的非基因编码区 (Locus Control Region, LCR) 内的染色质组蛋白末端修饰状态以及染色体结构等表观遗传学调控机制的变化，对于真核基因的转录调控具有重要的作用，且具有发育时相的特异性(Fang et al. Mol. Cell Biol, 2005；Fang et al. J. Mol. Biol., 2007；Yin W et al. Blood. 2007)。3) 参加DNA组分总汇计划(ENCODE)，以人类胚胎干细胞及其红系分化系统为模型，利用高通量的测序平台，研究真核基因在干细胞分化过程中的表观遗传学调控机制。已经发现在人类基因组的非编码区内存在着大量组织器官和发育时相特异性的调控序列，它们通过各种反式作用因子及其协同蛋白的相互作用，形成复杂、精细的网络调控系统。

职 称: 研究员

职 务: 博士生导师

研究方向: 干细胞分化的表观遗传学机制；真核基因的表观遗传学调控

主要研究领域：

主要的研究方向是真核基因的表观遗传学调控。目前的研究内容包括：(1) 分析正常人和典型疾病患者的全基因组表观遗传学图谱，在全基因组范围内筛选新的顺式调控元件和反式调控因子，确定它们的生物学功能和作用机制；(2) 研究真核基因在细胞发育和分化过程中的表观遗传学调控规律；(3) 探讨染色质的组成与结构在真核基因转录调控中的作用机制。主要实验技术包括染色质免疫沉淀技术(chromatin immunoprecipitation assay，ChIP )、DNase I或小球核酸酶(micrococcal nuclease，MNase)作图、染色体构象捕获(chromosome conformation capture，3C)、以及高通量DNA测序技术(next-generation sequencing)等。

代表论著：

·王海，阮修艳，方向东*. 位点控制区(LCR)调控基因表达的研究进展. 生命科学，2010；22(1): 74-8

·Cui P, Zhang L, Lin Q, Ding F, Xin C, Fang X, Hu S, Yu J. A novel mechanism of epigenetic regulation: Nucleosome-space occupancy. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2010; 391(1): 884-9

·Fang X, Yin W, Xiang P, Han H, Stamatoyannopoulos G, Li Q. The higher structure of chromatin in the LCR of the beta-globin locus changes during development. J. Mol. Biol. 2009; 394(2): 197-208

·Fang X, Chang K-H, Bates D, Diegel M, SandstromR, Weaver M, Dorschner MO, Sabo PJ, Papayannopoulou T, Stamatoyannopoulos G, Stamatoyannopoulos J. Chromatin Profiling of the Globin Loci of Human ES Cells and ES-Derived Erythroid Cells [abstract]. Blood 2009; 114(22): 997

·Yin W，Barkess G，Fang X，Xiang P，Cao H，Stamatoyannopoulos G，Li Q. Histone acetylation at the human beta-globin locus changes with developmental age. Blood 2007; 110(12): 4101-7

·Olave IA，Doneanu C，Fang X，Stamatoyannopoulos G，Li Q. Purification and identification of proteins binding to the hereditary persistence fetal hemoglobin (HPFH)-198 mutation in the gamma-globin gene promoter. J Biol Chem. 2007; 282(2): 853-62

·Fang X，Xiang P，Yin W，Stamatoyannopoulos G and Qiliang Li. Cooperativeness of the higher chromatin structure of the beta-globin locus revealed by the deletion mutations of HS3 of the LCR. J Mol Biol. 2007; 365(1): 31-7

·Li Q，Fang X，Olave I，Han H，Yu M，Xiang P，and Stamatoyannopoulos G. Transcriptional potential of the gamma-globin gene is dependent on the CACCC box in a developmental stage-specific manner. Nucleic Acids Res. 2006; 34(14): 3909-16

·Xiang P，Fang X，Yin W，Barkess G，Li Q. Non-coding transcripts far upstream of the epsilon-globin gene are distinctly expressed in human primary tissues and erythroleukemia cell lines. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2006; 344: 623-30

·Fang X，Sun J，Xiang P，Yu M，Navas PA，Peterson KR，Stamatoyannopoulos G，Li Q. Synergistic and additive properties of the beta-globin LCR revealed by 5'HS3 deletion mutations: Implication for LCR chromatin architecture. Mol. Cell Biol. 2005; 25(16): 7033-41

·Xiang P，Han H，Barkess G，Olave I，Fang X，Yin W，Stamatoyannopoulos G，Li Q. Juxtaposition of the HPFH2 enhancer is not sufficient to reactivate the gamma-globin gene in adult erythropoiesis. Hum. Mol. Genet. 2005; 14(20): 3047-56

· Fang X，Sun J，Man Yu，Navas PA，Peterson KR，Stamatoyannopoulos G，and Li Q. The 5’ HS3 core element of the beta-globin LCR is essential for formation of an active chromatin domain in the entire beta-globin gene locus in adult erythropoiesis [abstract]. Blood Cells Mol. Dis. 2005; 34: 85-6

·Li Q，Fang X，Han H，and Stamatoyannopoulos G. The minimal promoter determines silencing of the galago gamma-globin gene in adult erythropoiesis. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004; 101(21): 8096-8101

·Fang X，Han H，Stamatoyannopoulos G，Li Q. Developmentally specific role of the CCAAT box in regulation of human gamma-globin gene expression. J. Biol. Chem. 2004; 279(7): 5444-9

·Fang X，Sun J，Barkass G，Navas PA，Peterson KR，Stamatoyannopoulos G，Li Q. The 5’ HS3 core element of the beta-globin required for formation of hyperacetylated histone domains in the LCR and delta/beta-globin gene region during adult erythropoiesis [abstract]. Blood 2003; 102(11): 516a

· Fang X，Duan Z，Han H，Rohde A，Stamatoyannopoulos G，Li Q. Mechanism of NF-Y in regulation of human gamma-globin promoter [abstract]. Blood Cells Mol. Dis. 2003; 31(1): 151-2

·Fang X，Yu M，Han H，Stamatoyannopoulos G，and Li Q. Development-specific epigenetic code alteration induced by mutations in the human gamma-globin gene promoter [abstract]. Blood Cells Mol. Dis. 2003; 31(1): 152

·Fang X，Peterson KR，Li Q，Stamatoyannopoulos G. Locus control regions [chapter]. In: Makrides SC，ed. Gene Transfer and Expression In Mammalian Cells. St. Louis: Elsevier Science B.V.; 2003. pp. 397-409

·Li Q，Peterson KR，Fang X，Stamatoyannopoulos G. Locus control regions [review]. Blood 2002; 100(9): 3077-86 (cover story)

·Duan ZJ，Fang X，Rohde A，Han H，Stamatoyannopoulos G，Li Q. Developmental specificity of recruitment of TBP to the TATA box of the human gamma-globin gene. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002; 99(8): 5509-14 (joint first authors)

·Fang X，Duan Z，Stamatoyannopoulos G，Li Q. Transfactor NF-Y facilitate in vivo TBP recruitment on the human gamma-globin promoter [abstract]. Blood 2001; 98(11): 496-497a

· Chen C，Wang Q，Fang X，Xu Q，Chi C，Gu J. Roles of phytanoyl-CoA alpha-hydroxylase in mediating the expression of human coagulation factor VIII. J. Biol. Chem. 2001; 276(49): 46340-6

·Fang X，Chen C，Wang Q，Gu J，Chi C.The interaction of the calcium- and integrin-binding protein (CIBP) with the coagulation factor VIII. Thromb. Res. 2001; 102(2): 177-85

·Chen C，Fang XD，Zhu J，Wu XF，Zhang ZC，Gu JX，Wang ZY，Chi CW. The gene expression of coagulation factor VIII in mammalian cell lines. Thromb. Res. 1999; 95(2): 105-15

·方向东，高基民，林来兴妹，马骊，王小宁. 人G-CSF新型高效表达克隆的构建与鉴定. 中国免疫学杂志，1998; 14(5): 375-377

·方向东，马骊，高基民，黄树其，王小宁. 人G-CSF基因重组及在大肠杆菌中的表达和鉴定. 中国生化药物杂志，1998; 19(1): 1-5

·方向东，林来兴妹，高基民，黄树其，马骊，周峻岭，王小宁. hG-CSF大肠杆菌表达产物的纯化与鉴定. 中国生物制品学杂志，1997; 10(1): 1-4

·方向东，高基民，马骊，周峻岭，黄树其，刁志宏，陈泽洪，王小宁. 双诱导模式原核表达系统的建立与应用.第一军医大学学报，1997; 17(4): 253-257

·方向东，黄树其，周峻岭，马骊，刁志宏，陈泽洪，周明乾，王小宁. 人G-CSF重组表达系统稳定性的实验研究.第一军医大学学报，1997; 17(4): 314-316

·方向东，陈淳，谢志伟，耿解萍，王小宁，戚正武. 牛碱性成纤维细胞生长因子在酵母系统中表达. 生物工程学报，1996; 12(增刊): 261-265

·方向东，刘宏，周峻岭，黄树其，陈淳，谢志伟，戚正武，王小宁. 牛碱性成纤维细胞生长因子在酵母中表达产物的纯化与鉴定. 第一军医大学学报，1996; 16(3): 198-201

·方向东，黄树其，陈淳，耿解萍，谢志伟，王小宁，戚正武. 牛碱性成纤维细胞生长因子cDNA的克隆及其酵母重组表达质粒的构建. 第一军医大学学报，1996; 16(2): 78-81

·方向东，刘宏，王小宁. 新型受体药物CTLA4-Ig的应用. 生命的化学，1996; 16(4): 40-41

·方向东，陈淳，诸江. 用于扩增较大DNA片段的PCR方法. 生命的化学，1995; 15(2): 37-38

·方向东，陈淳，戚正武. 血管性假血友病的研究进展. 实用医学杂志，1995; 11(6): 406-408

·方向东，黄洪莲，曹钧，黄建生，张明军，黄春媚，王小宁. 以菌体作载体制备伤寒杆菌脂多糖抗血清. 细胞和分子免疫学杂志(单克隆抗体通讯)，1994; 10(1): 61-62

·方向东，王小宁，高基民. 甲型血友病诊断和治疗进展. 自然杂志，1993; 16(9-10): 23-24，5

参编著作:

·方向东，王琪. 染色质. 见: 陈淳、徐沁译. 高级分子生物学要义; 1版. 原著: Twyman RM; 北京: 科学出版社，2000; 33-41

·方向东，郭志兵，刁志宏. 细胞凋亡与免疫系统疾病. 见: 姜泊主编. 细胞凋亡的基础与临床; 1版. 北京: 人民军医出版社，1999; 206-223

·方向东，郭志兵，刁志宏. 艾滋病与细胞凋亡. 见: 姜泊主编. 细胞凋亡的基础与临床; 1版. 北京: 人民军医出版社，1999; 229-235

·方向东，郭志兵，刁志宏. 细胞凋亡与微生物感染性疾病. 见: 姜泊主编. 细胞凋亡的基础与临床; 1版. 北京: 人民军医出版社，1999; 240-247

·方向东，罗爱武，王小宁. 肿瘤基因治疗的研究进展. 见: 吴孟超主编. 中国肿瘤临床年鉴; 1995卷; 1版. 乌鲁木齐: 新疆人民出版社，1995; 15-20