多种酶靠非共价键相互嵌合催化连续反应的体系，称为多酶复合体（multienzyme complex）。连续反应体系中前一反应的产物为后一反应的底物，反应依次连接，构成一个代谢途径或代谢途径的一部分。由于这一序列反应是在一高度有序的多酶复合体内进行，从而提高了酶的催化效率，同时利于对酶的调控。在完整细胞内的许多多酶体系都具有自我调节能力。多酶复合体的相对分子量很高，例如脂肪酸合成酶复合体相对分子质量为2，200× 103；E.coli 丙酮酸脱氢酶复合体的相对分子质量为4，600× 103。

还有一些多酶体系在进化过程中由于基因的融合，多种不同催化功能存在于一条多肽链中，这类酶称为多功能酶或串联酶。

多酶复合体结构包括：辅基、辅酶、辅因子；

辅因子：酶蛋白中非蛋白质部分，它可以是无机离子也可以是有机化合物

辅酶：有机辅因子与酶蛋白结合松散即为辅酶

辅基：有机辅因子与酶蛋白结合紧密即为辅基