E-6B 空中指挥所，美国波音公司制造，造价高达8800万美元。E-6B装备有一个机载发射控制系统，该系统使得该飞机可以发射陆基洲际弹道导弹。

E-6B合同包含的工作有修改在E-6B后继作战试验和评价中发现的缺陷和不足，同时用新的综合开放式系统结构替代原有串联式任务系统结构，内容包括设计、开发、安装完全综合的系统，并在系统综合实验室和生产型飞机上试验。所有工作将在2008年9月完成。

第一批改装项目包括6大领域：改进的任务航电处理器系统将解决任务计算机系统性能退化和支持未来性能提升；数字式机载双向通信和交换系统/双向通信系统将提高可靠性和协同工作能力；超高频指挥、控制和通信设备将提高无线电通信可靠性；具有多级安全性的开放式系统结构将促进工作分配、信息交换和协同工作，并使新系统和技术更新更快、更经济；新环控系统和电源系统将支持告警使用，并且不需地面保障。

第一批改装合同包括一份5年的系统研制和验证合同，以及2架低速初始生产飞机的意向。剩下的飞机将在后续全速生产合同中改装。计划2010年达到初始作战能力，2014年达到完全作战能力。