词条 | DEPC |
释义 | DEPC性质简介焦碳酸二乙酯(DEPC):DEPC即diethypyrocarbonate,中文名为焦碳酸二乙酯。分子式为C6H10O5,分子量为162.14。是一种强烈但不彻底的RNA酶抑制剂。它通过和RNA酶的活性基团组氨酸的咪唑环结合使蛋白质变性,从而抑制酶的活性。DEPC可以抑制植物细胞上的NSCC,即nonselective cation channel (非选择性阳离子通道)。是常用的NSCC抑制剂. DEPC毒性1.DEPC(diethypyrocarbonate,焦碳酸二乙酯) 是一种高效烷化剂。配置:加0.1% DEPC到去离子水中,混匀过夜,然后高温高压121℃, 20min, DEPC即降解成二氧化碳和水无毒。 2.DEPC有刺激性,对眼睛气道粘膜有强刺激,在操作中应尽量在通风的条件下进行,DEPC毒性并不是很强,但吸入的毒性是最强的,使用时戴口罩,不小心占到手上注意立即冲洗。 3.DEPC是一种潜在的致癌物质,主要是能生成乙酯基衍生物和乙酯类衍生物,其中尿烷是一种已知的致癌物质。 DEPC水泡过一次枪头后还能再用吗?是否每次都要重配? 答:不能再用。每次处理耗材时都要用新配的。 DEPC水用于配制电泳缓冲液和溶解RNA. DEPC在水中的半衰期25℃、磷酸缓冲液中其半衰期为4 min(pH 6)、9 min(pH 7)。Tris缓冲液中DEPC的降解会加快,25℃时,半衰期为1.25 min(pH 7.5)、0.37 min(pH 8.2)。 DEPC加入到水中之后并不会立即溶解,而是形成小的球状液滴(类似于油滴),需要彻底搅拌直至液滴消失才算混合均匀。此时的溶液才可以拿去高温除菌除DEPC。一般灭菌15min即可将DEPC彻底除去。(试验所用试剂也可用DEPC处理,加入DEPC至0.1%浓度,然后剧烈振荡10分钟,再煮沸15分钟或高压灭菌以消除残存的DEPC,否则DEPC也能和腺嘌呤作用而破坏mRNA活性) 配制泡实验器具的DEPC水的配制:1000ml双蒸水中加1mlDEPC,放在1000ml容量瓶中静置4小时后备用。(DEPC在高压时分解为二氧化碳和乙醇,所以,用来处理实验器具的DEPC水,就不能高压) 配75%乙醇的DEPC水的配制:100ml盐水瓶内装40ml双蒸水,加40ulDEPC,37℃过夜,送至高压。(用来配制试剂的DEPC水是可以高压的。) 用途DEPC是一种有效的核酸酶抑制剂,它能够与很多酶的-NH,-SH或-OH等基团发生反应,从而破坏酶的活性位点。一般,常用浓度为0.1%(1 L水中加入1 mL DEPC)的DEPC来作为RNA酶的抑制剂。比如,进行RNA实验时,要用DEPC处理实验所用的水和各种溶液。 我们通常所说的DEPC(处理)水是指用DEPC处理过并经高温高压消毒的MiliQ纯水。DEPC(处理)水可以用于RNA沉淀的溶解,含有RNA的各种反应体系如反转录、siRNA的退火等,以及其它各种要求无RNase、DNase和proteinase的反应体系。 使用注意事项1、DEPC可能溶解掉某些塑料枪头,因此,量取DEPC时要用玻璃器具。 2、DEPC处理后的溶液要去除残余的DEPC,一般121℃灭菌15 min即可,也可以将其煮沸15 min以达到去除的效果。可能会残留些许气味,可以放心使用。 3、因为DEPC在Tris、HEPES等缓冲液中极易分解,因此不能直接用DEPC来处理Tris、HEPES等缓冲液。这种情况下,要先用DEPC处理水,然后再用DEPC处理过的水来配制缓冲液。 |
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