足印图谱法 foot printing method

足印图谱法 foot printing method 为利用DNA与蛋白质结合，在结合的区域不易再受DNA分解酶或化学修饰下而分析与蛋白质相互作用的DNA部位的方法。是与指纹图谱法对比而提出的术语，意思是分析DNA上印有的蛋白质印迹。具体作法是，用32P标记含有作为目标领域的DNA片段的一个末端。在与蛋白质结合之后，用DNA分解酶（核酸内切酶）在温和条件下使之发生作用，或在一定条件下用化学方法分解DNA。分解产物可用聚丙烯酰胺凝胶电泳法按链长将之分开，用放射自显影法而测定DNA的片段。在不存在蛋白质的情况下，DNA从标记的末端开始，在不规则的部位被分解，可得到连续的梯状花纹。与此相反，与蛋白质结合时，因该部分的DNA不分解，花纹就变得不连续的状态，结合蛋白的部分可在梯状花纹的空白部分找出。应用此法可分析阻遏物和RNA聚合酶的结合部位。