卓乃湖保护站，是位于保护区腹地卓乃湖旁流动的帐房保护站，卓乃湖站点海拔4790米，是藏羚羊集中产仔的地区，距青藏公路180公里

各保护站除负责各自辖区内野生动物和生态环境保护，开展巡山反盗猎斗争，此外，还担负着接应和支援主力巡山队的后勤保障工作，在青藏公路进行路查和向保护区周边地区群众进行宣传教育的任务。