重庆市卫生信息中心是重庆市卫生局直属卫生专业信息机构，同时承担重庆市卫生局电子政务系统的建设和维护、履行整合全市医疗卫生信息资源的政府职能。本中心原为重庆市医学情报研究所，经二十余年的建设，目前已发展成为西南地区规模较大的综合性医疗卫生专业信息机构。为适应新时期加快卫生信息化发展建设的要求，于2002年7月改名为重庆市卫生信息中心。本中心拥有完善的现代信息技术手段，具备卫生信息收集、整理、分析、研究、传递和推广的良好服务条件，专业技术力量雄厚。中心内设有综合信息科、医学图书馆、文献检索室、计算机室、《重庆医学》编辑部、《国外医学临床生物化学与检验学分册》编辑部、《检验医学与临床》编辑部、综合业务拓展部等业务科室，是卫生部指定在重庆市唯一的医疗卫生查新咨询服务机构。

本中心业务用房1400余平方米，馆藏大量中外文医学期刊，并引进了美国国立医学图书馆MEDLINE医学文献光盘数据库检索系统，另有多种权威性的光盘专业检索数据库。中心内建有计算机局域网。近几年来，本中心积极参与卫生软科学研究，在区域卫生规划和决策、文献检索、图书管理等领域取得了多项获奖科研成果，为推动重庆市卫生事业发展做出了积极贡献。目前，本中心正在按照重庆市政府《关于把重庆建设成为长江上游医学中心的规划》中明确提出的到2010年建成西南乃至全国有一定影响的卫生信息中心而努力奋斗。