中国水产科学研究院水产生物应用基因组中心是国内成立的第一个水产生物基因组专业研究机构，是立足全院、面向国内外开放的水产生物技术研究的公共实验平台。中心已与美国奥本大学建立了联合实验室。中心的宗旨是聚集国内外优势力量，整合科技资源，努力提升我国水产基因组研究与应用水平，支撑行业发展。中心的主要任务是开展水产生物基因组研究和遗传育种公共技术研发，培养水产生物技术人才，组织承担重大项目和开展高水平学术交流。

基因组中心实行主任负责制，同时设立由国内外著名专家组成的学术顾问组和由院生物技术学科委员会委员组成的学术管理委员会，由全院共同参与中心研究工作的决策和管理。

中心目前设立基因组资源开发、功能基因克隆验证和种质资源鉴定、水产生物工程与遗传育种等多个实验室。

具体研究方向：

水产动物基因组学研究 水产动物重要性状和功能基因研究 水产生物分子育种学研究