应用植物分类学、生态学、细胞学、现代分子生物学、引种驯化学等理论、技术和方法，开展重要植物类群的系统演化及发育重建、生物多样性的遗传学基础、物种形成的机制和分布式样、珍稀濒危植物的逆境抵御机制及保护生物学、重要植物类群及功能基因的适应性进化等研究。并利用基因工程、遗传工程等技术手段，开展重要植物的种质及基因创新。