浙江省农业科学院畜牧兽医研究所创建于1911年，主要从事畜禽优良品种选育及规模化饲养技术、胚胎工程技术、动物营养与饲料资源开发利用技术、畜禽传染病和寄生虫病诊断防治新技术等研究。

在农业部组织的全国1200多个农业科研单位参评的“八五”科研开发综合实力评估中排名第21位，全国专业所中位居第3，在本省所有农业科研所中名列榜首。

畜牧兽医研究所现有在职职工92人，具有高级职称科技人员25人（研究员8人，副研究员17人），其中院学科首席专家2人，省“151”人才9人，博士后流动站导师6人。所下设猪育种、饲料营养、草食家畜、家禽、兽医共5个研究室和1个省重点实验室——浙江省畜禽遗传育种试验基地。拥有2.5万头规模的种猪试验场、年出栏无公害商品猪2万头的浙江绿嘉园牧业有限公司及波尔山羊种羊场、种兔场。为了加速科技成果产业化，投资1800万元在海宁对外农业开发区建立了无公害规模化养猪示范基地，应用国际最新养猪技术－SEW系统为总体技术框架，集成“绿色”猪肉生产技术，该项目为养猪新方向提供了示范。

主持及参加完成各类科研课题共计120多项，获部省级以上成果42项，其中国家二、三等奖4项，部省一、二、三等奖38项。选育成瘦肉型猪配套新品系杜洛克和浙中白猪，高产蛋鸭配套系江南Ⅰ号、江南Ⅱ号、青壳Ⅰ号和白壳Ⅰ号，粗毛型长毛兔新品系等优良畜禽。用酶技术开发大麦型饲粮及其产业化，非常规饲料开发利用技术，畜禽氨基酸营养学和理想蛋白质模式，畜禽添加剂、预混料、青绿饲料开发利用，优质肉牛高效快速低成本肥育，优质无铅皮蛋加工，家畜胚胎工程，鸡、鸭、兔、猪主要疫苗高效防治新技术，牛羊寄生虫诊断技术等研究领域，在国内外处于领先或先进水平。