浙江大学控制科学与工程学系成立于1956年，现有工业控制研究所、自动化仪表研究所、智能系统与控制研究所，工业控制技术国家重点实验室，工业自动化国家工程研究中心和自动化实验教学中心。现有中国工程院院士1名，长江特聘教授1名，国家杰出青年基金获得者2名，教授29名，副教授46名。现有在校本科生400余名，在校硕士生400余名，在校博士生近200名。

浙江大学控制科学与工程学系的科研文化根基穏固，以应用为本，积极支持教学人员进行具影响力、富实用价值的研究，多年来坚持以国家重大需求为出发点，始终坚持基础理论与应用研究结合，近年来承担了众多国家级科研项目，科技成果为国内领先，部分达到国际先进水平，分别获得过国家科技进步二等奖、省部级科技进步一等奖等奖项20多项。控制系主要研究方向为：复杂工业过程建模与先进控制；集散控制系统设计与开发；企业综合自动化系统；流程工业CIMS技术；基于网络的工业控制系统设计与工程设计；现场总线控制系统的基础理论与技术；大系统的分解、协调、优化；信息处理及网络管理系统研究与开发；离散事件系统和混杂系统建模与优化；先进控制系统和计算机软件实现；环境系统工程的理论和方法研究；智能控制系统研究与开发；人工神经网络控制；复杂工业过程参数的集成化检测技术，软测量技术、多相流及特种参数的检测、新型智能化传感器的研究以及产业化、信息融合技术研究等。

1956年，浙江大学按教育部要求，开始筹建“化学生产的操纵及检验仪器”专业。

1958年，专业名称更改为“化工生产过程自动化及仪表”，简称“化自”。

1961年，化自专业首届本科生毕业，并开始招收研究生。

1981年，专业名称更改为“工业自动化”，被国务院学位委员会批准为首批博士学位授予点。

1984年，招收首批博士研究生。

1984年，成立工业控制技术研究所，下设四个研究室。

1989年，被国家教委确定为博士后流动站。

1989年，筹建工业控制技术国家重点实验室，这是国家计委批准建设的第一批国家级高科技研究重点实验室之一。

1997年，成立控制科学与工程学系。

1999年，控制系与光电系、信电系等系组成了浙江大学信息科学与工程学院。

2006年，举行化自专业创建50周年大型庆祝活动。

2008年，控制系成为浙江大学院级单位，开始独立运行。

2009年，控制系承办2009中国自动化大会暨两化融合高峰会议。