伊犁师范学院哈萨克文化研究所是以哈萨克文化研究为主的辐射哈萨克历史、民俗、宗教、语言、文学等多学科、多领域的人文与社会科学研究机构。哈萨克文化研究所的前身,是隶属于学院科研处的“哈萨克文化研究室”,该室于1991年10月成立。1997年11月原“哈萨克文化研究室”更名为“哈萨克文化研究所”,并与“新疆唐加勒克研究会”合署办公,挂靠于中文系(现人文学院)。学院奎屯校区设立的哈萨克族阿依特斯艺术研究中心,也隶属于哈萨克文化研究所。研究所现任兼职所长为乌鲁木齐拜教授,副所长为赛力克布力副教授。现有校内外兼职研究员50名。

研究所成立以来,在组织课题申报、举办学术会议、出版学术著作、培养学术梯队、转化学术成果以及建设特色学科资料室等方面做了大量工作。研究所把哈萨克非物质文化(包括阿依特斯)的研究、保护,哈萨克传统文化在现代生活中的地位和作用,哈萨克文学,哈萨克语言,哈汉双语教育教学,哈萨克族自古以来在中亚、伊犁一带的活动等作为主要研究方向。