药物专利，有时候也被叫作药品专利，是就药物申请的专利，包括药物产品专利、药物制备工艺专利、药物用途专利等不同的类型。

药品产品专利主要有药物化合物、西药复合制剂、中药组方和中药活性成分等。中药活性成分又包括了有效部位和单一化合物两种。

药物方法专利主要有药物化合物的制备方法、西药符合制剂的制备方法、中药活性成分的提取方法、质量控制方法和老药改剂型方法等。

药物的用途发明专利，是指对已知药物发现了某一不为人知的新用途时，我们可以针对这一用途本身申请专利，从而使得其他人不能将该药物应用于这一用途。比如著名的伟哥专利，就是新用途专利。

对某一技术的研发是无止境的，每次进步都可以对该进步本身申请专利。比如，对某一化合物申请专利后，并不意味着对该化合物的所有操作都不能再申请专利了，而是可以继续对该化合物的优选制备工艺、包含该化合物的复合制剂、该化合物的新用途等再分别申请专利。

当前，我国药物专利申请的质量问题主要体现在公开充分和创造性两个方面。这是由我国的药物研发水平和专利代理水平两方面的因素决定的。要克服这两个方面的问题，首先需要专利代理人具备相当的专利代理能力，另外，还需要专利申请人积极配合专利代理人的工作，积极补充所需要的材料。