位于南安市石井镇西北隅的杨子山上。

史载，该座书院始建于唐·景福二年（893年）。杨子山原名崎髻山，唐末五代初时期，南安水头人杨肃因治好了皇太后和闽王王后的疾病，唐·昭宗封崎髻山为杨子山，敕南安石井杨子山的杨肃读书处为杨林书院，此为泉州最早的书院。

南宋，理学大家朱熹曾在杨林书院讲学，引得四方贤豪来访求教。

后人在朱熹讲学处举建朱祠，曾再三迁建。杨子山现存3方与后人纪念朱熹有关的碑刻：

①《清水岩重建朱文公祠碑记》，镶嵌在杨林书院遗址大厅正墙上，清·乾隆四十九年（1784年）重建清水岩时立的，详细记述迁址重建始末和规制。

②《清水岩重建朱文公祠碑记（五文昌祠附）》，位于清水岩右下侧大榕树下。

③《兆元阁朱子祠碑记》，清·道光年间在青云梯上方新建兆元阁遗址时立。

杨林书院已废，但遗址仍可辨。遗址坐北朝南，东头是隔开的三个小间，中部是一过道，西端为大厅。遗址前有一块不知立于何时的“唐·杨肃、宋·吕大奎、泊有明诸先辈俱读书于此”石刻。根据《闽书》等记载，在杨子山授课、读书的，还有宋·举人林文彬、明·钦赐进士黄钺及郑普、李文缵、吴复清、许拱等