延庆县卫生局是全县卫生工作的主管部门，担负着全县的医疗、预防、保健、急诊抢救、健康教育等工作，主要包括贯彻执行国家和北京市卫生工作方针政策，制定本地区卫生发展规划并组织实施；对执业医师、执业护师、乡村医生的资格进行审批并监督管理；审批医疗机构，发放医疗机构执业许可证；审批发放卫生许可证、职业人员健康合格证；对供水、供水的设备、用品、场所、设施进行卫生监督；贯彻献血法，审批临床及急诊抢救用血；推进新型农村合作医疗工作，制定社区卫生服务规划；对母婴保健工作实施监督管理和分类指导；预防、控制和消除传染病的发生、传播与流行；对食品生产和经营者进行食品卫生监督；贯彻落实国家关于爱国卫生运动方面的方针、政策，积极开展农村改水改厕和市级卫生村创建工作。