香港湿地公园特别地区于2005年10月1日起生效的《香港湿地公园(特别地区)令》使香港湿地公园成为香港最新的特别地区。此命令授权郊野公园及海岸公园管理局总监（即渔农自然护理署署长）管理湿地公园，使之得到更好的保护和管理。