公元前221年秦统一六国，于邳置县，下邳县治所在今江苏邳州市之下邳故城。属东海郡（治郯县，在山东郯城县西南15公里）。

公元前202年(西汉汉高帝五年)，封韩信为楚王治下邳。次年废除韩信王号，封刘交为楚王，治彭城（今徐州市）。下邳县隶属楚。

公元前117年(西汉汉武帝无狩六年)，置临淮郡，下邳临淮。

公元9年(王莽始建国元年)，改下邳为润俭。

公元29年(东汉光武帝建武五年)，吴汉拔郯城，置下邳郡。旋改下邳郡为临淮郡，下邳为郡治所。

公元72年(东汉明帝永平十五年)，取消临淮郡，置下邳国，都下邳(今江苏邳州市之下邳故城)。

公元193年(汉献帝初平四年)陶谦任徐州牧，下邳为州郡治。

魏初，迁徐州治所于彭城（徐州市），仍置下邳郡。下邳为郡治。公元280年(晋武帝太康元年)置下邳国，下邳为国都。

公元326年(晋成帝咸和元年)，刘闽杀下邳内史夏侯嘉降石勒，下邳入后赵，改置下邳郡。

公元525年(北魏魏孝明帝孝昌元年)，置东徐州治下邳县。公元533年(南朝梁武帝中大通五年)，入梁，梁置武州治下邳。公元550年(东魏孝静帝武定八年)，复置东徐州治下邳。公元575年(陈宣帝太建七年)，陈将樊毅伐北齐克下邳，陈改东徐州名安州。

公元579年(北周宣帝大成元年)，陈的徐州、淮南之地尽没于北周，周改安州为邳州。

一直至隋初，下邳一直为州郡治所。

公元607年(隋炀帝大业三年)，改置下邳郡（治宿预。在今宿迁市区东南），下邳县属之。

公元621年(唐高祖武德四年)，置邳州，下邳县为州治。

公元628年(太宗贞观元年)，废除邳州，下邳县隶于泗州。

公元809年(宪宗元和四年)，下邳隶于徐州。

公元907年至960年，下邳县属武宁军（今江苏铜山县治），隶于徐州。

公元982年(太宗太平兴国七年)，北宋置淮阳军治下邳县。

公元1129年(金太宗天会七年)金置邳州，下邳县为州治。

明初废下邳县入邳州。

公元1912年(民国元年)，改州为县，称邳县。属徐海道。

公元1992年8月，建为邳州市，江苏省委托徐州市代管。