词条 | 系统生物学中多组学综合数据库 |
释义 | 系统生物学中多组学综合数据库,以中国科学院北京基因组研究所自2003年以来在基因组学、转录组学领域上取得的科研成果为基础,以公开发表的基因组学、转录组学数据为核心,以研究所自产的原始数据及二级分析结果为补充,从而形成的一个整合基因组、转录组的多组学综合数据库系统。通过对基因组和转录组相关数据信息的搜集、整理和整合,旨在建立国内首个OMICS数据存储中心,为医学、作物学、发育学、遗传学、计算学等相关学科领域的科研人员提供主要的数据存储、下载和服务中心。 本数据库目前已经建设或正在建设的子库有:水稻基因组数据、家蚕基因组数据、家鸡基因组数据、流感病毒基因组数据以及人类基因组多态性数据。其中水稻基因组数据收录了两个不同品种的数据即indica 9311和Syngenta japonica,同时,收录了最新的scaffold、contig序列信息以及gene、snp等注释信息;家蚕基因组数据收录了基因组所自产的Bombyx moi物种的contig原始数据以及gene注释等数据;家鸡基因组数据收录了基因组所自产的三个不同种类鸡(肉鸡、蛋鸡、乌鸡)的原始序列信息以及这三个物种在cDNA、gene等之间的差异信息;流感病毒基因组数据收录了覆盖中国、美国、澳大利亚等111个国家,时间从1902年到2006年间的禽流感和猪流感的cds、segment、utr以及蛋白质等数据,数据有一部分为基因组研究所自产数据,另外一部分来源于NCBI;人类基因组多态性数据目前收录了人的hg18版本的dbSnp数据,该部分数据来源于NCBI和ENSEMBL。 |
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