西南大学植物保护学院始建于1952年，学院现有在职教职工52名，兼职教师11名。其中博士生导师8名，教授、研究员14名，副教授、副研究员15名，高级实验师1名，部级有突出贡献专家1名，享受政府特殊津贴者4名，教育部新世纪优秀人才支持计划入选者1名，中国农业科学院二级岗位杰出人才1名，重庆市学术与技术带头人及后备人选4名，巴渝学者特聘教授1名，,重庆市名师1名。学院现有昆虫学及害虫控制工程重庆市市级和高校级重点实验室，植物病害生物学重庆市高校级重点实验室。植物保护一级学科为重庆市重点学科，拥有植物保护一级学科博士授予权，有4个博士学位授权点，同时设有植物保护一级学科博士后流动站。

植物保护学院现有三个系（植物病理学系、昆虫学系、农药学系），两个本科专业——植物保护和制药工程专业（农药方向）。半个世纪以来，学院共培养本科生3099名、硕士研究生206名、博士研究生47名、博士后3名，为云、贵、川、藏等地培训植物保护和粮食储藏保护技术干部1500余人。 2002年起承担了国家对外经济贸易部支援发展中国家培训项目(TCDC)--国际储藏物保护技术培训班。2006、2007年分别承办了农业部西部病虫害预测预报技术培训和全国植物检疫网络技术培训班，培训合格基础骨干技术人员170余名，得到各级领导和学员的肯定。

近五年来该院共承担包括国家重点基础研究发展规划973、863、国家自然科学基金、国家攻关项目以及省部各级项目64项，获部省级以上科研成果43项，获部省级以上奖励的有32项，其中一等奖8项、二等奖18项，三等奖6项；出版专著和全国统编教材29部、发表论文610多篇。分别有2篇博士和3篇硕士学位论文获重庆市优秀学位论文，其中1篇博士学位论文获全国百篇优秀博士学位论文提名奖。