西藏自治区社会科学院宗教研究所筹建于1980年，1985年正式成立哲学宗教研究所，1988年改名为宗教研究所。宗教研究所现有10名研究人员。其中，7名硕士，3名本科；2名研究员、4名副研究员、2名助理实习员、2名研究实习员。主要研究方向为藏传佛教、苯教和宗教哲学三大领域。

在宗教所原顾问——已故著名学者波米?强巴洛追先生及黄文焕、马久、何宗英（三位领导后任本院副院长）等历任领导的主持下，经宗教所全体科研人员共同努力，取得了一系列成绩。近年来，宗教研究所取得的主要研究成果有：

19本专著——《拉萨地区寺庙简志》、《聂荣县寺庙志》、《雪域沉思录》、《藏族哲学的理智》、《西方哲学词典》、《新思维浪潮——探求藏传佛教的思考》、《藏族文化与知识经济》、《语言概论新探》、《阿里史话》、《阿里阿钦寺壁画艺术研究》、《苯教五行算法》、《藏族传统文化与野生动物的保护》、《楚布寺志》、《哲蚌寺新志》、《苯教史》、《西藏宗教史》、《十一世纪至十二世纪寺庙调查研究》、《藏传佛教中弘期有关问题考》、《藏传因明逻辑思维新谈》、《阿里文明史》、《藏传佛教噶举派》、《藏传佛教格鲁派》、《藏传佛教萨迦派》、《藏传佛教宁玛派》等。

8本译著——《雅拉香布山下的文明》、《昌珠寺史事大观》、《蔡公堂寺通史》、《仓央嘉措道歌》、《松赞干布传略》（以上5部皆为藏译英）、《西方藏学专家苯教研究论文集》（英译藏）、《扎芭林札——晓谕四方书》、《因明学》等。

5本合著——《西藏封建农奴制社会形态》、《西藏宗派宗论》、《西藏森巴战争》、《宗教知识手册》、《西藏宗教知识丛书》等。