吴忠市审计局成立于1983年5月，2010年机构改革后，内设5个科（室）、2个特派办：办公室(内设法规科)、经济责任审计室、财政审计科、行政农业审计科、经贸投资审计科、利通区特派办、红寺堡特派办。

审计局现有在职人员31人，其中，少数民族干部14人，占总人数的45%。具有硕士学历1人，本科学历10人，大专学历18人；获得会计师职称5人，审计师职称9人，经济师职称2人，高级政工师1人,，政工师1人，注册工程造价师1人。

现任审计局党组书记、局　长：张继业