温州医学院基因组医学研究院于2009年3月22日成立，中国遗传学会表观遗传专业委员会主任孙中生担任院长。 目前实验室共有20余名固定研究人员（其中高级职称13人，中级职称4人，初级职称5人）， 另有访问学者、在读硕士生共计40余人。

本院的主要研究方向是从功能基因组和表观基因组水平上研究复杂疾病发生发展的遗传基础和表观遗传机制，以及在疾病形成过程中，遗传和环境之间的交互作用，以期为提高我国疾病防控能力、提高人民健康水平、促进医药产业发展做出基础性、战略性和前瞻性的贡献。

本院依托于有良好样本资源、病理诊断技术先进的温州医学院及其附属医院，有效地整合并扩大温州医学院现有的疾病样本资源，建立起国内一流的生物样本收集库，并对这些样本进行深入、全面地全基因组相关分析和表观基因组学分析，建立起基于学校，面向全国开放的功能基因筛选平台、表观遗传学平台、转基因模式动物构建平台。

实验室科研人员承担国家“973”、“863”重大基础研究前期研究专项项、国家自然科学基金6项、浙江省自然科学基金重大项目1项、浙江省自然科学基金面上项目5项等省部级以上研究课题达18项 。

根据国家“十一五”发展规划及本学科现状，基因组医学研究院在建设发展过程中，将贯彻知识创新，科教兴国的战略方针，实行开放的、与国际接轨的PI管理体制和运行模式，在严格实验室管理的基础上，力求创造一个自由、开放、合作式的研究环境。