王世科（？～？），字号不详，浙江仁和人。明世宗嘉靖二十三年（1544）甲辰科武举会试第一人。

王世科，杭州前卫指挥使，得中武状元后，历任后军都督府都督佥事，充任镇守广西总兵官，挂征蛮将军印。万历二年（1574）十月，王世科由广西柳庆右参将调回京师，提督京营。万历四年（1576）正月，晋升为提督巡捕，署都指挥佥事。又以三年内缉获盗贼有功，受到神宗皇帝的多次奖赏，晋升为后军都督府都督佥事（正二品）。万历五年（1577）正月，神宗登皇极殿，召见文武百官，为其弟潞王朱翊詗举行盛大的冠成大礼之后，潞王在东庑接见百官，命京城内外巡捕、署都督佥事王世科改任南京前军都督佥书，而以浙江总兵李超代行王世科在京师的职务。