皖南医学院形态实验中心成立于2000年12月，设有主任一人，副主任三人。根据形态学科实验教学特点，中心下设有医学生物学、人体解剖学、组织学与胚胎学、病理学、微生物学与免疫学、人体寄生虫学六个实验室和一个中心实验室。

中心有实验任课教师70余人，副教授以上职称20人；实验技术人员20人，高级实验师9人。中心实验用房面积为5158m。教学仪器设备共1750件，总价值为7136944.54元.中心现有35个教学实验室,其中:数码显微镜互动实验室3个;多媒体网络微观实验室12个;人体解剖多媒体教室7个;人体解剖实验室9个;面向学生开放的实验室有:人体解剖标本陈列馆、解剖模型陈列馆、形态标本陈列室和形态音像室。中心实验室主要为形态实验教学和科研活动提供公共平台。

由中心主任董群教授主持的省重点教学研究项目《构建形态学科公共实验教学平台》以及其它实验教学研究课题均取得良好的效果。中心所拥有的高素质师资队伍；精良的教学设备和优美的教学环境，为培养基础扎实、实践能力强、知识面广、综合素质高的应用型医学人才创造了良好的条件。