吐尔尕特出入境检验检疫局成立于1999年11月28日，由原吐尔尕特进出口商品检验局、吐尔尕特动植物检疫局和吐尔尕特卫生检疫局合并组建，是新疆出入境检验检疫局的直属机构，实行新疆出入境检验检疫局直接领导的垂直管理体制，主管辖区内的出入境卫生检疫、动植物检疫、进出口商品检验、鉴定、认证和监督管理工作，属国家行政执法机关和涉外经济监督部门。

吐尔尕特出入境检验检疫局规格为正县（处）级，局本部位于新疆维吾尔自治区克孜勒苏柯尔克孜自治州吐尔尕特口岸，内设办公室、检务科、旅检科和检验检疫监管科等四个职能科室，在伊尔克什坦口岸设有办事处，规格为副县（处）级。局本部现有干部职工22人，由维、汉、柯三个民族组成，其中大专以上学历者14人，占全部人数的63%，是一支政治强、业务精、素质好的队伍。

该局现任局长郝宝盛，男，汉族，山西榆次人，中共党员。。1985年在红其拉甫卫生检疫局参加工作，1994年以来历任红其拉甫卫生检疫局副局长、局长，喀什出入境检验检疫局副局长、吐尔尕特出入境检验检疫局伊尔克什坦办事处主任，2002年4月任吐尔尕特出入境检验检疫局局长。2004年自治区大通关先进个人，2007年克州优秀党务工作者，2007年新疆检验检疫系统先进个人。

2007年，该局共检验检疫查验出入境货物9392批次、27.72万吨、货值19970.72万美元。检出进出口不合格货物36批次、838.46吨、货值61.68万美元。检疫查验出入境旅客15304人次，检疫查验出入境车辆31510车次，预防性卫生处理入境车辆15810车次。截获禁止携带进境动植物、动植物产品及其它检疫物83批、418.2公斤。查验来自喀什和乌鲁木齐两地的出境转关车4957车次。

吐尔尕特检验检疫局2003年获自治区级文明单位称号。长期以来，坚持以邓小平理论为指导思想，以“讲学习、讲政治、讲正气”为中心，以“内强素质，外树形象”为基础，以“严格把关，监管有效，方便进出、管理科学”为宗旨，真抓实干，勇于开拓，着力提高干部职工的思想觉悟和综合素质，着力培养职业荣誉感和责任感，形成了良好的职业道德风尚，将精神文明建设作为树立检验检疫形象、维护执法公正的长期性、基础性的工作，坚持领导到位、规划措施到位、工作责任到位，切实把精神文明创建工作纳入全局工作计划之中，注重经常性教育和日常创建工作，有效增强了群众间的凝聚力，提高了干部职工的思想素质，有效推动了检验检疫工作向前发展。2008年，获自治州最佳自治区级文明单位称号。

2001年、2002年两次获得全国质检系统先进集体荣誉，2003年获自治区级文明单位称号，2004年获得克州招商引资先进单位，连续7年获口岸先进集体称号；多人次获新疆检验检疫系统先进个人、自治州大通关先进个人、自治州优秀党务工作者、口岸先进个人等荣誉。

今后，吐尔尕特检验检疫局将继续着重抓好以下方面的工作：一是完善疫情疫病监控体系和风险预警机制，加强重点敏感商品检验监管，提高应对口岸突发公共卫生事件的快速反应能力、紧急处置能力和检验检测能力，防止境外不合格商品和有毒有害物质流入我国。二是落实和完善产品质量和食品安全监管的长效机制，提高检验监管的有效性，巩固和扩大专项整治成果，加强出口产品和食品口岸查验，完善饮服行业卫生监督管理机制，加大巡查力度，有效维护国家形象和国门安全。三是加快诚信体系建设，提高企业自律意识。以加强检验检疫监管、确保产品质量安全为目标，需要进一步规范和加强对报检单位和报检员的管理，明确对代理报检单位、自理报检单位及报检员日常监督管理的规定，规范代理报检单位信用等级评定和分类管理工作，增加工作的透明度，建立“良好企业名单”和“黑名单”制度，推行“奖优罚劣、优胜劣汰”的奖惩机制。四是深入贯彻执行以ISO9000质量管理体系为基础、绩效考核为核心的综合行政管理体系，提高依法行政水平。通过推行综合行政管理体系，切实加强对整个检验检疫行政执法过程的有效控制，保证依法行政、文明行政，全面提高管理水平和工作质量。五是加强党风廉政建设和精神文明建设。进一步加强思想建设和队伍建设，加强执法能力、检测能力、服务能力、保障能力和创新能力，提高执法把关水平，树立文明、高效、廉洁的检验检疫执法形象。为促进地方和口岸的经济健康快速发展做出更大的成绩。