特殊培养基：包括厌氧培养基和细菌L型培养基，以及运输培养基、鉴别培养基、鉴定培养基、选择培养基等。厌氧培养基是培养专性厌氧菌的培养基，除含营养成分外，还加入还原剂以降低培养基的氧化还原电势。细菌L型培养基是针对细胞壁缺损的细菌L型，由于胞内渗透压较高，故培养基必须采用高渗低琼脂培养基。

基础培养基也可以作为一些特殊培养基的基础成分， 再根据某种微生物的特殊营养需求，在基础培养基中加入所需营养物质。