苏州大学苏南发展研究院成立于1999年10月，为首批江苏省哲学社会科学的重点研究基地，是苏州大学直隶的跨学科研究机构，多年来，研究院围绕苏南率先全面建设更高水平小康社会的目标，加强苏南经济社会发展中重要理论和现实问题研究，在决策咨询、服务社会、学科建设、人才培养和机构发展上取得显著成绩，形成重要社会影响。 2009年4月，省哲学社会科学规则领导小组研究决定，由省哲学社会科学规则办公室和苏州大学共同建设苏南发展研究院，运用省社科规则课题资源和学校科研优势，加强苏南发展研究院建设。2009年6月，经校务会议研究决定，对苏南发展研究院院长和副院长作出调整，田晓明同志为苏南发展研究院院长（兼）；袁勇志、金太军、王卫平、刘电芝、赵增耀、胡玉鸿为苏南发展研究院副院长（兼）;顾建平同志为苏南发展研究院副院长。

苏南发展研究院已在新的组织机构下开始工作，其建设目标、基本定位、组织架构日益清晰，制度建设正在完善。