首都科技发展战略研究院成立于2011年8月10日。研究院旨在围绕“将北京建设成为全国创新发展的核心引领区和具有全球影响力的科技创新中心”的目标，搭建首都科技发展战略研究平台，探索服务和利用首都科技智力资源的体制机制，为率先实现创新驱动的发展格局、促进首都科学发展提供研究决策支撑。

首都科技发展战略研究院将采取“小核心、大网络”的“联盟式”开放组织方式，建立“开放、竞争、流动、协作”的运行机制，探索战略研究课题的新型组织模式和管理机制。