生物扰动作用（bioturbation）是生物由于其生活活动搅乱、中断和破坏了原来的沉积成因的物理成层构造或沉积组构的作用。如一些环节动物和海参等泥食动物在沉积物中吞食大量泥沙，以摄取有机物质，同时排出大量粪粒混入沉积物，破坏了原来的沉积物结构，进行了再沉积作用。由生物扰动所形成的构造称为生物扰动构造（bioturbation structure），如潜穴、逃逸构造、爬行迹等。