深港发展研究院是深港产学研基地理事会于2006年指定成立的，隶属于深港产学研基地的研究部门。深港发展研究院利用产学研基地本身具有的北京大学、香港科技大学和深圳市政府的合作背景，充分整合两所大学及其他机构的资源，将自身打造成为深圳具有重要影响力的脑库、区域创新资源的聚合高地和开放的区域研究公共平台。
深港发展研究院主要从事公共政策建议、重点领域科技与产业研究、区域可持续发展和社会发展研究等，为深圳创新型城市建设与深港合作出谋划策，提供高质量的决策咨询。
主要研究领域包括：区域发展重大问题、产业发展关键技术研究、区域合作研究等。