上醍醐是醍醐寺的开创地。山路约3.5km，陡坡接连不断，所要1小时。登山口位于下醍醐的女人堂处。在海拔约450m的山上有很多庙宇供游客参拜，往返需要3小时。清泷宫拜殿(国宝)位于上醍醐入口处，涌出的醍醐水是关乎醍醐寺院创建的灵泉。在它的背后的准胝堂是醍醐寺祭拜的中心，也是日本关西地方参拜观世音菩萨的第11号灵地。正尊的准胝观音像是秘藏佛像，只在每年5月18日日以做法事而对外开放，在5月18日的前后几天也可以参观。此外于1124年(保安5年)完成的还有上醍醐最古老的建筑物-药师堂(国宝)、放置有五大明王像。