上海中医药大学继续教育学院位于上海市徐汇区零陵路530号。学院依托学校医教研学科优势和雄厚的师资力量举办各类成人教育，是上海中医药大学成人教育的专职办学部门和管理机构。下设办公室、学历教育中心、非学历教育中心、拓展部。

学院办公室在院长领导下，组织制定继续教育学院工作计划，负责协调院内各教务管理岗位教学安排以及与学校内外相关部门的协调工作。

学院学历教育中心主管成人高等学历教育。目前设有夜大学专科、本科、专升本层次的中医学、中药学、临床医学、护理学、保健按摩等专业；中药学自学考试。上海中医药大学是中药学专业（专科段、独立本科段）的高等教育自学考试主考学校。

学院非学历教育中心接受上海市卫生局、上海市食品药品监督管理局、上海市人事局等部门的委托，承担了继续医学教育和执（从）业药师继续教育的培训工作。以及面向社会（中医药专业技术人员、广大群众和港澳台同胞）举办多层次多形式的各类中医药职称考试考前辅导班、成人高考辅导班、中医中药防病治病、保健养生知识普及和技能（岗位）培训班。

学院拓展部负责协助学院领导拟定学院的年度发展计划及中长期发展规划、新项目开发以及学校系统国家级继续教育项目组织申报等。