上海市农业科学院是市属的综合性农业科研机构，成立于1960年。下设9个研究机构， 拥有5个国家级技术平台、2个市级重点实验室和一批科技公共服务平台。

全院现有在职职工1000名，其中专业技术人员471人，高级专业技术职务科技人员166名，硕、博士168名，国务院特殊津贴专家65名。形成了种质创新和遗传改良、设施园艺技术、生态农业技术、农业生物安全与标准化、农产品保鲜加工、高新技术农业应用、都市农业理论等优势学科（领域）。与30多个国家或地区开展科技交流和合作研究。编辑出版《上海农业学报》和《食用菌》等7种学术类、技术类刊物，重点培育生物疫苗、食（药）用菌、种子种苗三大科技产业，科技服务立足上海、辐射长三角，服务全国“三农”。

“十五”以来，紧紧围绕市委、市府提出的实施科教兴市主战略和建设农业科技强市以及都市型现代农业的目标，坚持自主创新，加强学科、平台、基地和队伍建设，不断提升科技创新能力和自我发展能力。全院共承担国家、部（市）级以上科研攻关项目443项，获得部（市）级以上科技成果奖49项，其中，市科技进步一等奖7项，126个农作物新品种通过审（认）定。

面对新形势，坚持“科技立院、开发兴院、人才强院、开放办院”的治院方针，力争到2010年基本建成国内一流、国际有影响的具有都市型农业特色的现代农业科学院和区域性的都市型农业科研中心，成为农业科技创新基地、科技成果转化展示基地、人才培养基地和国际农业科技合作交流基地，为上海率先基本实现农业现代化、建设都市型现代农业提供科技支撑。