汕头保税区国家税务局的前身是汕头市国家税务局保税区分局，1995年经广东省国家税务局批准（备案）并挂牌成立，为汕头市国家税务局派驻汕头保税区的直属机构。于2005年进行的机构改革中正式成立汕头保税区国家税务局，全局干部职工共有10人。我局是汕头保税区主管国家税收工作职能部门，为正科级全职能局。内设4个行政机构、1个直属机构、1个事业单位。其中：办公室、综合业务股、办税服务厅（加挂“计划统计股”牌子）、税源管理股为内设行政机构，稽查局为直属机构，信息中心为事业单位。