三系即不育系，保持系，恢复系。三系法主要是用于配套不育系育种。主要原理是：

首先把杂交母本转育成不育系，例如，希望杂交组合（甲×乙）利用已有的雄性不育性进行制种，则必须先把母本转育成甲不育系，常用的做法是利用已有的雄性不育材料与甲杂交，然后连续回交若干次，就得到甲不育系。原来雄性正常的甲称为即成为甲不育系的同型保持系，它除了具有雄性可育的形状以外，其它形状均与甲不育系相同，故又称同型系，它能为不育系提供花粉，保证不育系的繁殖留种。父本乙必须是恢复系。如果乙原来就带有恢复基因，经过测定，就可以直接利用配置杂交种，共大田生产用。