咸丰十一年至宣统元年(1909年)，热心公益事业的上海穆斯林集资在日晖港陆续购地70余亩，建立日晖港清真公墓。墓地由上海清真董事会管理，墓区以孝、悌、忠、信、礼、义、廉、耻八字编号，为上海最大的穆斯林公墓。

孝字地　同治三年(1864年)建成，墓区2.345亩。光绪五年(1879年4月13日)，全国著名武术家、山东马永贞被人暗害，遗体安葬该处。1964年，市政建设需要征用该地，坟墓迁到保安公墓。

悌字地　俗称“茶馆背后地”，因巷口有茶馆而得名。同治八年置地1.854亩；光绪四年，置地1.55亩；民国29年(1940年)，上海回教堂理事会又置地0.331亩，建国后土改时测定悌字地面积为4.735亩。1960年，建造卢湾体育场被征用，坟墓迁葬吉安公墓。

忠字地　俗称“老坟地”。从光绪八年至光绪三十二年，先后6次共置地10.774亩，建成忠字墓区。此后又陆续购置土地，扩建墓区。民国33年，该墓区共有土地23.19亩。为日晖港清真公墓中最大的墓区。上海伊斯兰教界知名人士哈少夫、马长生、金子云、石子藩，爱国民主人士、复旦大学教授马宗融均安葬该墓区。尹神武烈士因刺杀袁世凯爪牙上海镇守使郑汝成，后因叛徒出卖被捕，于民国7年惨遭杀害，也安葬于此。1960年，建造卢湾体育场被征用，坟墓迁葬吉安公墓。

信字地　俗称“老十块地”。光绪二十一年，置地5亩建成墓区。其中有印度尼西亚婆罗洲旅沪侨商的坟墓，现存石碑1方，保存于上海回民公墓。

礼字地　俗称“石人石马地”。因墓区西南有明代布政司潘允端的墓地，墓道两旁，树立石人石马，故名。光绪三十三年置地3.198亩建成墓区。京剧著名坤角琴秋芳安葬于此。1960年，因市政建设需要被征用，遗址现为上海篷垫厂。

义字地　光绪二十四年置地6.899亩建成墓区，供贫寒穆斯林廉价或无偿安葬亡人。该地与廉字地毗邻，墓区之间有小巷，巷口有上海伊斯兰教界知名人士马乙棠书“清真墓地”题词。

廉字地　墓区占地5.367亩。亦是供贫寒穆斯林安葬亡人。1964年，因市政建设需要被征用，坟墓迁至保安公墓。遗址现为上海第三机床厂厂址。

耻字地　俗称“新地”，“十九块地”。民国16年(1927年)、民国18年两年分4次置地8.128亩建成墓区。1964年，因市政建设需要被征用，现为上海市第六十四中学、行知艺术师范学校校址。

日晖港清真公墓除上述“八字编号”的墓区外，还有一些未编号的墓区。如：(1)“七家坟”，系七姓穆斯林于民国6年购置2.782亩土地建成，供七家穆斯林丧葬之用。(2)浜南特别墓地，上海清真董事会于民国6年，购地3.005亩菜田建成墓区，因未列入“八字编号”，故称“特别墓地”。(3)鸡鸭菜馆业穆斯林置地3.02亩，建成“鸡鸭地”墓区。(4)安徽太和县旅沪穆斯林置地1.38亩，建成的“太和县新地”墓区。(5)茶陵路175号墓区，即沪南区八图阎字吁13号6丘1.363亩等。

日晖港清真公墓之间有一条小路，路名清真路。如今，日晖港清真公墓由于市政建设需要，已经迁葬他处。但是，清真路依旧保存。