日本防灾科学技术研究所主要承担了针对大城市地震防灾的尖端模拟技术，包括震灾综合模拟系统以及海啸灾害综合模拟系统的开发等。

除了在实验室里进行研究，该研究所还在全国约1800个地点设置了各种地震仪，能够准确观测从微小地震到大地震的各种地震活动，并且将收集的数据通过互联网广泛公布，用于弄清地震活动的机理和减轻地震灾害的研究。

值得一提的是，该研究所的另外一个任务是对地震活动和受灾情况进行预测研究，以期在大地震来临前及时将有关信息通知地方政府和产业部门等。