医学技术系于2006年成立，全系以服务社会为宗旨，以就业为导向，突出“双证”培养模式为特色，以培养学生实践目标能力、职业素养与创新精神为重点，大力推行工学结合，校企合作的发展道路，以为国家培养应用型、技能型、创新型高素质专业医学技术人才为目标。全系现有眼视光专业、医学影像技术专业、医学检验技术专业、药学专业四个学校特色专业。全系专业教师40人，硕士研究生6人，教授10人、副教授7人。拥有功能齐全的实验室，实习基地、云南省190职业技能鉴定所及实习医院，有功能完善的附属综合性医院一所，属国家三级乙等医院。教师队伍具有较强科研能力，获国家专利1项，拥有有云南省同类医高专学校唯一一门省级精品课程【五官科护理学】，有云南省教育厅科研基金项目1个，校级科研课题2个。国家级规范教材《五官科护理学》副主编1人，全系教师已发表的各类国家级论文多达30余篇。

医学技术系各专业有实验室30间，面积共 2100m，各类专业设备技术先进、功能齐全。

检验实验中心设备有双目显微镜50台，半自动血液细胞分析仪、半自动生化分析仪、尿液分析仪、超净工作台、双通道血凝仪、酶标仪、洗板机、电泳仪、高速离心机，高压蒸气锅、电热恒温水浴箱、恒温箱、天平等，各类寄生虫标本、血片骨髓片1690多份。

影像实验中心有数字化多媒体医学影像阅片室、超声检查实验室、影像检查技术实验室，设备有：多媒体音频系统、计算机、投影仪、数字展台配套设备，影像观片灯20台、黑白超声检查仪1台、一体化超声诊断仪1台、全自动化洗片机1台。

眼视光实验中心设备有日本拓普康综合验光仪、电脑验光仪、苏州六六视觉裂隙灯显微镜、角膜曲率仪、苏州六六视觉眼底镜、手动式视野机、苏州六六视觉带状光检影镜、模拟眼、半自动磨边机、倒边机、打孔机、烘烤机、开槽机、焦度计。

药学实验中心设备有紫外线分光光度仪15台、家兔解剖手术台、分析天枰15台、红外线频谱分析仪。

此外学校还有基础实验室6个（解剖、病理、微生物寄生虫、生理、生物、药理），机能中心及显微中心各1个，拥有大量实体标本及显微观察设备，能开展解剖标本制作，病理标本制作及观察，寄生虫标本制作及微生物检测，动物实验；拥有公共课实验室4个（化学、物理、语文、数学）,语音室3个，计算机中心1个，能开展以上各门课的实验教学，英语听力培训和测试，计算机能力培训和考评，为学生素质全面发展奠定基础；拥有临床技能实训中心（内、外、妇、儿、传染、五官）及护理技能实训中心，临床技能培训中心有模拟人、洗手设备、手术器械、心电图机、标本若干。护理技能实训中心有护士站、输液室、治疗室、ICU模拟实验室，能开展诊断、内科、外科、妇产科、儿科、传染、基础护理、临床护理、检验、影像、眼视光五官、药学各种实验及技能培训，各专业在实习前还开展技能操作大赛，决出了“技能标兵”,为学生的实习提供了良好的实训平台为医学生学好专业课打下了坚实的专业基础。