清源山摩崖石刻共有360多方，分布在36个岩洞上，比较集中分布在清源洞(89方)、赐恩岩(77方)、弥陀岩(72方)、南台岩(41方)、瑞象岩(18方)。年代最早为宋代，文体内容风格各异，书法形式多样，有篆、隶、楷、草，字径有大、中、小，最大字径达4.18×3.90米。泉州历代书法家及历史名人，大都留有手迹。

“大明‘蜕岩’”，款“致仕知州陈惠”

在清源洞顶巨岩上，南向，幅高0.64米，宽1.10米。楷书，字径0.32×0.44米(落款字径不标，下同)。陈惠，晋江人，官山西沁州知州。

“紫泽洞天”，款“刘用行书”

在清源洞下洞，东北向，幅高1.47米，宽1.60米。楷书，字径0.66×0.53米。刘用行，南安人，宋嘉定元年(1208年)进士。

“虎乳”，款“吕道人乙丑仲夏游清源留题”

在紫泽洞东侧石坡上。东南向，幅高0.84米，宽0.80米。行书，字径0.48×0.36米。吕道人身世不详。

“君恩山重”，款“俞大猷书”

在紫泽洞西侧上方清源古道旁，东向，幅高2.70米，宽1.30米。楷书，字径0.64×0.61米。俞大猷，泉州人，有传。

“北山胜”，款“淳熙乙巳冬留坡陈正仲为蒙古作”

在清源古道入口处北侧，西南向，幅高1.30米，宽0.70米。楷书，字径0.24×0.28米。陈正仲即陈谠，仙游人，宋隆兴元年(1163年)进士。

“明嘉靖癸亥岁季春，钦差镇守福建南、赣、惠、潮兼郴、桂、南诏地方都督俞大猷提兵往兴化剿陷城倭寇，次月尽竣事班师，偕友人游诸洞。”

在清源古道中段小云关上方东侧，西向，幅高1.80米，宽1.40米。楷书，字径0.16×0.16米，5行，每行8～10字。

“万历甲戌春三山陈第从先师俞虚江游清源，辛丑秋再至，以铁如意击石吟曰：

‘重来三十年，感叹游非昨。

空馀梦寐存，九源讵可作。

徘徊石刻前，泪洒秋风落’。”

位于清源古道中段，俞大猷纪事题刻西侧，西向，框高1.8米，宽1.40米。行书，字径0.16×0.16米，6行，每行10字。陈第，连江人，曾为俞大猷幕下，出守蓟北，善诗文，精音韵之学。

“忠勤正直，咸丰甲寅仲春，赐浙江巡抚黄宗汉”

位于清源古道碧霄岩下，框0.78×2.24米，楷书，字径0.44×0.32米。黄宗汉，泉州人，有传。

“咸丰四年二月初二日内阁奉　上谕浙江巡抚黄宗汉，自简任以来，办理各路防堵，不动声色，措置裕如，督办漕粮海运亦极认真。上年剿捕台州及杭州之昌化于潜并宁波各处匪徒，与现在嘉湖而属聚众粮匪犯，均能立时擒获，办理甚属妥速，地方悉臻安静。历览该抚奏报，精详之至，并毫无瞻顾，深堪嘉尚。着发去朕书忠勤正直匾额，一并赏给黄宗汉。该抚领朕所赐御书，不必作奖励观，作纪实观。朕尤愿汝慎终如始，以成一代之名臣。钦此

臣黄宗汉勒石

臣何绍基恭录”

框0.74×2.24米，字径0.045×0.05米，楷书，22行，每行4～10字不等。

“抗直敢言”，“陈颂南先生在道光朝直声震天下，宣庙以此奖之。泐石名山，永垂不朽，后学莆田江春霖谨题”

在清源古道碧霄岩下，楷书，框1.65×3.90米，字径0.10×0.15米。陈颂南即陈庆镛，泉州人，有传。“抗直敢言”为道光皇帝御书赐赠。

“出岫无心”，上下款为“王子真书　天历壬申比丘白云立”

在南台寺东侧巨岩壁间，南向，框1.02×1.30米，楷书，字径0.15×0.49米。王子真身世不详。

“绝壁遏云”，款“万历己酉　孟冬之吉，守延陵姜志礼书”

位于南台寺后巨岩壁间，西向，框1.34×2.97米，行书，字径0.80×0.45米。姜志礼，明万历间任泉州太守。

“一啸台”，款“咫亭詹仰庇书”

位于弥陀岩一线天山门东侧，南向，楷书，字径0.72×0.54米。詹仰庇字汝钦，号咫亭，安溪人，明嘉靖四十四年(1565年)进士。

“观瀑丙子”

位于弥陀岩瀑布附近，西南向，竖写篆书，字径0.54×0.40米，题款已风化不清。

“‘曾枕清泉漱石时，老僧还指壁间诗。江山无改旧游寺，十四年来鬓有丝。’施世纶”

位于一线天出口处，西向，行书，字径为0.17×20米。施世纶字文贤，号浔江，晋江人，官云南巡抚，漕运总督。

“丙子春日游弥陀岩即景十韵。出郭寻芳：‘胜日登临玩物华，平畴万顷早禾嘉。山灵有意添春色，天半霏霏散雨花。’归途夕照：‘一鞭斜照出山隈，不尽春光暮霭来。按辔回看登眺处，浮清送翠意悠哉。’三韩马负书”(其余八首从略)

位于弥陀岩“一啸台”巨石东南侧，东南向，行楷，字径0.075×0.075米。近旁有杜昌丁、顾园东等人和诗(略)。马负书字易斋，清乾隆间武状元，任福建陆路提督军门，善诗书。

“留题弘一法师舍利塔：‘春满花枝不可寻，清源山上柏森森。悬知诸艺皆馀事，直契孤云有本心。东海学归偏托钵，南山律废赖传音。际天石塔巍峨在，依约昙光远照临。’甲子秋虞愚”

位于弥陀岩西侧，弘一墓塔前左侧巨石上，西向，行书，字径0.08×0.07米。虞愚，厦门人，中国社会科学院研究员，著名因明学家、诗人、书法家。

“‘悲欣交集’，弘一法师最后遗墨”

位于弥陀岩弘一法师墓塔前左侧，框高0.80米，宽0.90米，楷书，字径0.26×0.20米。弘一，俗名李叔同，有传。

“巢云岩”，款“颜廷榘时年九十有一”

位于弥陀岩瀑布东侧通瑞像岩路边巨石上，南向，楷书竖写，字径0.40×0.35米。颜廷榘字范卿，号祧陵先生，永春人，明嘉靖间官九江通判、岷府长史，著有《丛桂堂集》。

“‘浮云有变迁，流水无朝夕。清源孺子身，放歌我自适。’詹仰庇”

位于巢云岩西北侧，濯缨泉下方，东南向，草书，字径0.12×0.10米。詹仰庇被黜为民后，居巢云岩十三年。

“正仲为蒙古作‘望州亭’”

位于瑞像岩右后东侧，西南向，行书，字径0.33×0.23米。正仲即陈谠，仙游人，宋隆兴进士。

“明万历二十一年癸巳李开芳为唐欧阳行周先生书，裔孙模勒石‘高山仰止’”

位于赐恩岩寺后欧阳读书台岩壁间，南向，隶书，字径0.70×0.70米。李开芳字伯东，号还素，明万历进士，官南京太仆寺卿、两广藩皋，工书画，著有《尺风堂集》。

“宋李文肃公结岩醉月岩，后学何乔远构亭”

位于赐恩岩下，大旗山南麓，南向，楷书，字径0.60×0.50米。

“天开石室自何年，小(住旧居)访昔贤。一迳松风秋不断，半龛灯火夜长悬。(夕)阳(温映)岩前树，亭壑霜凝(竹)外烟。尽醉莫言(归)路晚，为逢知己尽留连。”上下款为“友人怀游欧阳先生石室”“万历丙辰秋叶向高”

位于“高山仰止”题刻东侧，南向，草书，部分已风化难辨，括号内据资料补足。字径0.10×0.10米。叶向高，福清人，官至宰相，与魏忠贤相抗争，辞职归里，慕何乔远人品，往访镜山书院，登欧阳读书室。