清华大学启迪创新研究院2009年12月10日正式成立。此举标志着清华科技园将加强在创新思想，以及创新体制、机制、模式、政策等领域的系统研究，致力于为国家创新体系的建设出谋划策。

研究院建成初期，将致力于研究在创新型国家建设过程中，如何通过政、产、学、研、金、介、贸、媒等各方面的要素整合，优化和完善区域创新环境，以更加先进的理念、机制和模式推动科技成果转化、促进创业企业发展和加速创新人才成长。

研究院还将借鉴世界一流研究机构的成功经验，突破传统学科划分体系，在组织形式、管理体制、运行机制和研究模式等方面不断创新。

清华大学启迪创新研究院首任院长由十一届全国人大常委会副委员长华建敏担任，此外还聘请多位国内外顶尖的理论家、科学家、企业家、管理学家等担任研究导师。

研究队伍采取小实体、大联合的模式，除精干的专职人员外，将聘请国内外顶尖的理论家、科学家、企业家等参与研究工作。