1898年秦港开埠，1975年成立煤炭作业区，1983年改称第三作业区，1987年正式命名为第三港务分公司。第三港务分公司是以煤炭装卸运输为主的生产经营单位。第三港务分公司现有7、8、9号3个万吨级深水煤炭专用输出泊位，年设计通过能力1365万吨；装卸设备138台（套），堆场33.14万平方米，堆存能力85万吨。

第三港务分公司提出“装卸生产主战场在港外，每一个产煤和用煤单位都是三公司客户”的市场开拓方针，按照股份公司整体部署的“以内蒙煤炭为主，以小船型为主，以市场煤炭为主”的板块模式，深入进行市场调研，广开门路，广揽货源，积极抢占计划外煤炭市场份额，为客户建立了便捷顺畅的沟通渠道，吸引了更多的客户进行多煤种煤炭交易。在生产组织上，努力提高装船效率，压缩船舶在港停时，成功开通了作为北煤南运物流链的“准班轮”运输模式；利用场地和设备灵活方便、计量准确、取样及时等优势，积极开展配煤业务，采用堆场配煤法、装船配煤法、卸车堆场配煤法，配置实施了严密的工艺流程，确保了客户所需煤炭质量。

新中国成立后，在国民经济发展的各个重要时期，第三港务分公司为“北煤南运”和国家经济建设做出了重要贡献；改革开放以来，经过技术改造生产能力不断提高，煤炭吞吐量最高达到1817万吨。第三港务分公司内强管理，外拓市场，凭着一股勇于拼搏的精神，一股敢与市场较量的气魄迎难而进，不断谱写老港区装卸生产新篇章。