1973年，内蒙冶金地质勘探公司成立，属内蒙古冶金厅管理。

1984年10月23日，内蒙冶金地质勘探公司上收，归中国有色金属工业总公司直管，改称为中国有色金属工业总公司内蒙古有色地质勘探公司。

1989年11月24日，中国有色金属工业总公司内蒙古有色地质勘探公司改称为中国有色金属工业总公司内蒙古有色地质勘查局。

2000年7月，中国有色金属工业总公司内蒙古有色地质勘查局下划到内蒙古自治区实行属地化管理，改称为内蒙古自治区有色地质勘查局，是自治区国土资源厅所属准厅级事业单位。

2006年4月，内蒙古自治区有色地质矿业（集团）有限责任公司挂牌成立，与内蒙古自治区有色地质勘查局并行，实行“一套人马、两块牌子、事企分开”的运作方式。

内蒙古自治区有色地质勘查局为自治区一支重要的集地质勘查和矿业开发为一体的综合性地质找矿队伍，拥有固体矿产勘查、勘查工程施工、区域地质调查、水文地质、环境地质调查、岩矿鉴定与岩矿测试等较高等级的资质，能够承担国家和自治区各类大型公益性和商业性的地质找矿和矿业开发任务。