内江市农科所成立于1936年，1958年扩建为研究学科较齐全的综合性研究所。现有在职职工168名，有研究员3名、副高级职称科技人员33名、中级职称科技人员36名；国家有突出贡献的专家1名；国务院津贴专家3名；四川省优秀专家1名。内设研究机构有：杂交水稻研究中心、甘蔗研究中心、旱作研究中心、玉米研究中心、生态农业研究中心。主要从事水稻、甘蔗、小麦、玉米、油菜、甘薯等作物遗传育种及品种改良研究。

国家先后投资建有四个国家级生产、示范、试验基地：“杂交水稻汕优多系1号等原原种、原种生产基地”、“国家农作物品种区域试验站”、“川东南生态农园示范基地”、“四川省内江优质专用玉米生产科研基地”。

先后完成了上百项课题研究，取得获奖成果61项，社会经济效益达80多亿元。为我市、我省的农业生产作出了贡献。

水稻科研为四川杂交水稻三次主栽品种换代和走出四川，在全国确立“川种优势”地位做出了贡献。先后育成了菲优63 、汕优多系1号、冈优多系1号、菲优多系1号、菲优99-14、汕优94-11、汕优92-4、汕优94-4、冈优94-4、冈优94-11、冈优99-14、冈优182、金优182 、II优多系1号、Ⅱ优9 2–4、Ⅱ优95-18 、N 优 6 9、N优94-11、N优92-4、内香优1号、内香优3号、内香优6号、内香优9号、内香优10号、内香优13号、内香优14号、内香优18号、内香2550、内香8514、内香8156、内香8518、内香2924等三十二个杂交稻组合，合作育成了K优5号、D优68、D优多系1号、C优多系1号、N优1577、国稻6号、菲优600、菲优188等八个杂交稻组合，共计四十个组合通过了国家或省级品种审定，在我国南方稻区各省推广应用。其中：菲优多系1号、Ⅱ优多系1号、冈优多系1号、冈优182、D优68、内香优1号、内香优3号等先后被确定为我省重点推广品种。汕优多系1号、菲优多系1号、II优多系1号、内香优5号、内香优3号、内香2550等优质杂交稻组合被评为四川省优质米，获得“稻香杯”奖。

甘蔗育种研究有悠久的历史，曾为四川和内江糖业经济提供了原料蔗科技支撑，国内知名度高。先后自育了川蔗1-6号、甜城1-18号，引育了果蔗“沱江红”等25个优良品种用于四川、重庆、云南、贵州等省市，累计推广面积1200万亩。“十五”育成审定的高糖品种甜城14号、果糖兼用品种甜城15号及果糖兼用新品种甜城17号、果蔗甜城18号各具优势和特色，特别适应当前农业产业结构调整的需要。??

近年小麦育种研究步入国内先进行列。先后育成了内麦6号、内麦8号、内麦9号、内麦10号通过国家或四川品种审定、合作育成了杂交小麦组合Ⅱ优58通过重庆市品种审定。内麦8号、内麦9号、内麦10号被确定为我省主要推广品种; 内麦8号、内麦9号2004、2005年先后被列入国家863计划“优质专用农作物新品种选育及繁育技术研究项目”资助品种、国家“粮补”品种。

内江市农科所高度重视知识产权保护，对38个自主知识产权新品种完成了植物新品种权保护申请，24个新品种已获得植物新品种授权。